近日,我國(guó)首個(gè)全自動(dòng)核酸蛋白共提取平臺(tái)在三亞崖州灣科技城投用。該平臺(tái)由上海交通大學(xué)海南研究院、深部生命國(guó)際研究中心三亞崖州灣研究基地提供原創(chuàng)實(shí)驗(yàn)技術(shù)、華大集團(tuán)定制開(kāi)發(fā)。樣本處理通量和效率與人工操作相比提升10倍以上,實(shí)驗(yàn)成本指數(shù)級(jí)降低。
全自動(dòng)核酸蛋白共提取系統(tǒng)通過(guò)全自動(dòng)機(jī)械臂整合不同儀器模塊,采用工位流水線(xiàn)設(shè)計(jì)理念,用于各類(lèi)生物樣本的蛋白、核酸自動(dòng)化高通量共提取,實(shí)現(xiàn)從一份樣本中同時(shí)提取出核酸和蛋白并完成肽段制備,并記錄過(guò)程產(chǎn)生的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),高效智能地對(duì)接下游的核酸建庫(kù)、測(cè)序、質(zhì)譜檢測(cè)等實(shí)驗(yàn)流程,產(chǎn)生多組學(xué)大數(shù)據(jù)并進(jìn)行宏組學(xué)聯(lián)動(dòng)分析。該平臺(tái)尤其適用于深海微生物樣本等低生物量的珍貴樣本提取,有助于提高實(shí)驗(yàn)效率、縮短數(shù)據(jù)產(chǎn)生周期,便于及時(shí)反饋科研結(jié)果并加快各類(lèi)生物資源開(kāi)發(fā)進(jìn)度。
上海交通大學(xué)海南研究院、深部生命國(guó)際研究中心科研人員章陶亮透露,人工操作核酸蛋白共提取實(shí)驗(yàn),一份樣本從提取到拿到核酸和蛋白(不包括DNA建庫(kù)和制備肽段)需要一天半的時(shí)間,一次僅能完成8個(gè)深海環(huán)境微生物樣本的提取,而自動(dòng)化核酸蛋白共提取平臺(tái)可同時(shí)進(jìn)行2個(gè)96孔板的交替提取,在相同時(shí)間段內(nèi)一次就能夠完成192個(gè)樣本的提取。
上海交通大學(xué)海南研究院教授、深部生命國(guó)際研究中心主任肖湘表示,深部生命國(guó)際研究中心崖州灣研究基地全力建設(shè)全新一代深海微生物綜合研究平臺(tái),圍繞深海微生物資源的采集、培養(yǎng)、挖掘、開(kāi)發(fā)等關(guān)鍵技術(shù)環(huán)節(jié),建設(shè)自動(dòng)化樣本庫(kù)與菌株庫(kù)、高通量核酸蛋白共提取系統(tǒng)、高通量厭氧微生物分離培養(yǎng)系統(tǒng)等全國(guó)產(chǎn)化技術(shù)與硬件設(shè)備,在海南率先實(shí)現(xiàn)深海微生物資源獲取和開(kāi)發(fā)的數(shù)字化與智能化。其中,全自動(dòng)核酸蛋白共提取平臺(tái)等系列自動(dòng)化科研平臺(tái)的建設(shè),將推動(dòng)深海微生物菌種獲取速度提升10倍、產(chǎn)生數(shù)據(jù)的效率提升百倍,標(biāo)準(zhǔn)化、高效化、智能化的平臺(tái)建設(shè)將有力推動(dòng)海南深海微生物資源產(chǎn)業(yè)化發(fā)展進(jìn)程。
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